2次逆浸透純水装置の動作ステップは、主に前処理、1次逆浸透、2次逆浸透、およびその後の処理のいくつかの段階を含む。
1、前処理段階：まず入水弁と排水弁を開き、原水ポンプを起動し、石英砂フィルタに水を供給して正洗を行い、水が澄みきるまで約5分間。その後、出水弁を開き、排水弁を閉じ、通常の運転状態に入る。石英砂ろ過器が一定時間作動した後、圧力差が0.08 MPaを超えた場合、水が澄むまで約10分間、排水弁と進水弁を開き、逆洗を行う必要がある。活性炭フィルターの操作は類似しており、約5分間洗浄しており、水が澄んでから正常運転に入った。
鄒2、一級逆浸透段階：前処理後の水は一級逆浸透ホストに入り、圧力の作用下で水分子は逆浸透膜を透過し、水中の90%以上の不純物を除去する。
鄒3、二級逆浸透段階：一級逆浸透の産水は二級逆浸透ホストに入って精密加工を行い、残留した微量イオンと不純物を徹底的に除去し、産水水質を70%近く安定的に向上させる。
4、後続処理段階：二級逆浸透の出水は必要に応じてEDI超純水設備或いは紫外線殺菌器などに入り、さらにイオンと微生物を除去し、最終的に高純水を得ることができる。
操作時には定期的に前処理設備に対して逆洗と再生を行い、各級の逆浸透の入出水圧力と水質を監視し、設備の正常な運行と出水水質の基準達成を確保する必要がある。